Hankkeen kuvaus
DNA-viivakoodauksen hyödyntäminen automaattisessa lajitunnistuksessa –projekti pyrkii yhdistämään DNA-viivakoodauksen ja kuviin perustuvan koneoppisen uudella tavalla automaattisen vesistöjen biomonitoroinnin edistämiseksi. Projektissa optimoimme lajitunnistusta kokonaisuutena, joka sisältää kuvantamis-, viivakoodaus- ja koneoppimisvaiheita, ja kehitämme uusia koneoppimisalgoritmeja kokonaisuutta edistävällä tavalla keskittyen kolmeen päätehtävään: 1) koulutusaineistoon kuuluvien lajien tunnistus, 2) koulutusaineistoon kuulumattomien lajien havaitseminen ja 3) biomassan automaattinen arviointi. Kaikissa näissä tehtävissä pyrimme hyödyntämään viivakoodaustuloksia uusin tavoin. Projektin aikana keräämme uuden suuren tutkimusta tukevan tietokannan.
Henkilöt hankkeessa
Vastuullinen johtaja: Erikoistutkija Jenni Raitoharju, YTO
Päätutkija: Mikko Impiö, YTO
Muu tuki SYKEn sisällä:
Johtaja Kristian Meissner, YTO
Erikoistutkija Eero Siivola, YTO
Kansainväliset yhteistyökumppanit:
Assoc. Prof. Alexandros Iosifidis, Aarhus University, Tanska, asiantuntemus hankkeessa: koneäly
Senior Researcher Toke T. Høye, Aarhus University, Tanska, asiantuntemus hankkeessa: ekologia
Prof. Florian Leese, University of Duisburg-Essen, Germany, asiantuntemus hankkessa: DNA-viivakoodaus
Lisätietoa
Erikoistutkija Jenni Raitoharju